Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn4Q62472 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn4Q62472 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn4Q62472 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn4Q62472 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Lcn4Q62472 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lcn4Q62472 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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