Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl12Q62401 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms