Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms