Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssr4Q62186 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssr4Q62186 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms