Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phox2aQ62066 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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