Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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PtafrQ62035 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtafrQ62035 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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