Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms