Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp2Q61990 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp2Q61990 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms