Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prg2Q61878 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prg2Q61878 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms