Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga6Q61739 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga6Q61739 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms