Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hes3Q61657 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hes3Q61657 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hes3Q61657 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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