Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli3Q61602 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms