Protein–RNA interactions for Protein: Q61574

Foxs1, Forkhead box protein S1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxs1Q61574 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxs1Q61574 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxs1Q61574 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms