Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim25Q61510 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim25Q61510 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms