Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itm2aQ61500 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itm2aQ61500 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itm2aQ61500 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itm2aQ61500 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itm2aQ61500 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itm2aQ61500 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms