Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne1Q61457 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccne1Q61457 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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