Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd53Q61451 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms