Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tfap2bQ61313 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tfap2bQ61313 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms