Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms