Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcd2Q61285 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcd2Q61285 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms