Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms