Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef1Q61210 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef1Q61210 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms