Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3c2aQ61194 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3c2aQ61194 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms