Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd3Q61060 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms