Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TmpoQ61033 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms