Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DbpQ60925 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DbpQ60925 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms