Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms