Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf4Q60793 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klf4Q60793 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms