Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf3Q60765 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf3Q60765 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms