Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samhd1Q60710 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms