Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CttnQ60598 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms