Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Utp20Q5XG71 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp20Q5XG71 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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