Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpa6Q5U901 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms