Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc5a6Q5U4D8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms