Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brip1Q5SXJ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brip1Q5SXJ3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms