Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbs12Q5SUD9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bbs12Q5SUD9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 830.3 ms