Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms