Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps41Q5KU39 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps41Q5KU39 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms