Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prkaa1Q5EG47 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkaa1Q5EG47 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms