Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp22Q5DU02 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp22Q5DU02 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms