Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms