Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chsy3Q5DTK1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chsy3Q5DTK1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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