Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f8Q58FA4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms