Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spire1Q52KF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms