Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ankrd28Q505D1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ankrd28Q505D1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms