Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3aQ4TU90 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3aQ4TU90 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3aQ4TU90 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3aQ4TU90 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3aQ4TU90 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox3aQ4TU90 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox3aQ4TU90 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms