Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3lQ4KL14 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms