Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syne3Q4FZC9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syne3Q4FZC9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms