Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp235Q499D5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp235Q499D5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms