Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc110Q3V125 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms